学校法人の理事長は一般的には設置する学校の校長（学長、園長）たる１号理事（私立学校法第３８条第１項第１号）がなることが多いですが、評議員から選任された２号理事（私立学校法第３８条第１項第２号）や寄付行為で定めるところにより（主に学識経験者）選任される３号理事（私立学校法第３８条第１項第３号）が理事長になるケースもあります。
上記１号理事については、寄付行為で任期の定めはなく、上記２号理事もしくは３号理事については寄付行為に任期の定めがあります。そのため、学校長など１号理事が理事長の場合は、学校長を辞めるまで理事長たる理事であります。
ただし、２号理事や３号理事が理事長になった場合は、寄付行為で定められている理事としての任期が満了すると理事長としての資格もなくなります。そのため、２号理事や３号理事が理事長になった場合は、改選期ごとに理事長選任（または重任）の登記をすることになります。
